（理学部は、江戸幕府の洋学所を濫觴とする）

明治10年（1877）

• 明治新政府は、東京開成学校と東京医学校を併合
• 東京大学を創設し、法、理、文、医の４学部を設置
• 理学部に、化学科、工学科、地質学及び採鉱学科、生物学科、数学・物理学及び星学科の5学科を設置
• 元江戸幕府薬園が植物園として理学部附属となる

明治13年（1880）

• 法、理、文の３学部に学士研究科を設置（大学院の前身）
• 地質学及び採鉱学科を、地質学科と採鉱学科に分離

明治14年（1881）

• 数学・物理学及び星学科を、数学科、物理学科、星学科に分離

明治18年（1885）

• 理学部を神田錦町から本郷に移転

明治19年（1886）

• 帝国大学令公布 帝国大学と改称し、法、医、工、文、理の5分科大学及び大学院を設置
• 理科大学に、数学科、星学科、物理学科、化学科、動物学科、植物学科、地質学科の７学科を設置
• 臨海実験所を、神奈川県三崎に設置

明治30年（1897）

• 東京帝国大学と改称
• 臨海実験所を、三崎から小網代新井城址に移転

明治34年（1901）

• 物理学科を、理論物理学科と実験物理学科に分離

明治35年（1902）

• 植物園分園を、栃木県日光に設置

明治40年（1907）

• 地質学科を、地質学科と鉱物学科に分離

大正8年（1919）

• 帝国大学令改正 東京帝国大学と改称し、法、医、工、文、理、農、経済の７学部を設置
• 地理学科を設置
• 星学科を天文学科に改称
• 理論物理学科と実験物理学科を、物理学科に統合

大正12年（1923）

• 地震学科を設置

昭和14年（1939）

• 人類学科を設置

昭和16年（1941）

• 地震学科を拡充して、地球物理学科を設置 合計11 学科となる

昭和22年（1947）

• 東京大学と改称

昭和24年（1949）

• 国立学校設置法公布 新制の東京大学創設

昭和26年（1951）

• 理学部は従来の11 学科を数学科、物理学科、化学科、生物学科、地学科の5学科に改編
• 大学院学制を制定

昭和28年（1953）

• 新制東京大学大学院設置
• 人文科学、社会科学、数物系、化学系、生物系の5研究科を設置

昭和33年（1958）

• 生物化学科を設置

昭和39年（1964）

• 地球物理研究施設を、茨城県柿岡に設置

昭和40年（1965）

• 大学院の数物系、化学系、生物系の３研究科を改組し、理学系、医学系、薬学系、工学系、農学系の5研究科を設置

昭和42年（1967）

• 天文学科と地球物理学科を設置

昭和45年（1970）

• 情報科学研究施設を設置

昭和49年（1974）

• 高エネルギー物理学実験施設を設置（時限5年）

昭和50年（1975）

• 情報科学科を設置（これに伴い、情報科学研究施設を廃止）

昭和51年（1976）

• 分光化学センターを設置

昭和52年（1977）

• 素粒子物理学国際協力施設を設置（時限7年）（高エネルギー物理学実験施設の時限による廃止）

昭和53年（1978）

• 中間子科学実験施設を設置（時限10年）
• 地殻化学実験施設を設置

昭和59年（1984）

• 素粒子物理国際センターを設置（時限10年）（素粒子物理学国際協力施設の時限による廃止）

昭和63年（1988）

• 中間子科学研究センターを設置（時限10年）（中間子科学実験施設の時限による廃止）
• 天文学教育研究センターを設置

平成3年（1991）

• 大学院重点化開始
• 地球物理学科と地球物理研究施設を改組して地球惑星物理学科を設置
• スペクトル化学研究センターを設置(時限10年）(分光化学センターの転換）

平成4年（1992）

• 大学院重点化により理学系研究科に、化学専攻、生物化学専攻、動物学専攻、植物学専攻、人類学専攻、地質学専攻、鉱物学専攻の７専攻を設置
• 数学専攻は、独立研究科として数理科学研究科となる

平成5年（1993）

• 理学系研究科に、情報科学専攻、物理学専攻、天文学専攻、地球惑星物理学専攻、地理学専攻の5専攻を設置 合計12 専攻となる

平成6年（1994）

• 素粒子物理国際センターは、全国共同利用施設として東京大学素粒子物理国際研究センターとなる（素粒子物理国際センターの時限による廃止）

平成7年（1995）

• 動物学専攻、植物学専攻、人類学専攻を統合し、生物科学専攻を設置

平成9年（1997）

• 大学院重点化完了
• 原子核科学研究センター（研究科附属）を設置（中間子科学研究センターの時限による廃止）

平成10年（1998）

• 学部附属施設の臨海実験所、植物園、地殻化学実験施設、スペクトル化学研究センター、天文学教育研究センターを理学系研究科附属施設へ移行

平成11年（1999）

• ビッグバン宇宙国際研究センターを設置 (時限10年）

平成12年（2000）

• 地球惑星物理学専攻、地質学専攻、鉱物学専攻、地理学専攻を統合し、地球惑星科学専攻を設置

平成13年（2001）

• 情報科学専攻が情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻へ移行
• スペクトル化学研究センターの時限延長(時限10年）
• 生物情報科学学部教育特別プログラムを設置（～平成24年度）

平成16年（2004）

• 国立大学法人化により国立大学法人東京大学となる

平成17年（2005）

• 超高速強光子場科学研究センターを設置
• アクチュアリー・統計プログラムを設置（～平成24年度）

平成18年（2006）

• 地学科を廃止し、地球惑星環境学科を設置

平成19年（2007）

• 生物情報科学科を設置
• スペクトル化学研究センターおよびビッグバン宇宙国際研究センターの時限廃止

平成20年（2008）

• 遺伝子実験施設は、全学センターから理学系研究科附属施設となる

平成23年（2011）

• フォトンサイエンス・リーディング（ALPS）大学院を設置（～令和6年度）

平成24年（2012）

• 小石川植物園（御薬園跡及び養生所跡）が文化財保護法により国の名勝及び史跡に指定される

平成25年（2013）

• フォトンサイエンス研究機構を設置

平成26年（2014）

• 生物化学専攻と生物科学専攻を融合し、新たな生物科学専攻を設置
• グローバル基礎科学教育プログラム（グローバルサイエンスコース）（GSC）を設置

平成28年（2016）

• グローバルサイエンス国際卓越大学院コース（GSGC）を設置
• 生物普遍性研究機構を設置

平成29年（2017）

• 宇宙惑星科学機構を設置

平成30年（2018）

• フォトンサイエンス国際卓越大学院プログラム（XPS）を設置（～令和6年度）
• 宇宙地球フロンティア国際卓越大学院プログラム（IGPEES）を設置
• 知の物理学研究センターを設置

令和元年（2019）

• 変革を駆動する先端物理・数学プログラム（FoPM）を設置

令和4年（2022）

• 超高速強光子場科学研究センターを改組してアト秒レーザー科学研究センターを設置

令和6年（2024）

• クォーク・核物理研究機構を設置