森下 真一教授
MORISHITA Shinichi
新領域創成科学研究科 生物情報科学科
| メールアドレス | moris@cb.k.u-tokyo.ac.jp |
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| 電話番号 | 04-7136-3984 | 63984（内線） |
| 居室 | 新領域総合研究棟371号室 |
| 外部リンク |
研究分野
バイオインフォマティクス, 計算最適化, 自動演繹
研究テーマ
１分子超高速DNA解読装置と超並列計算機を利用し、３次元クロマチン折り畳み構造、ヌクレオソーム構造と転写、ゲノム修飾と機能、個人ゲノム解読と疾患関連変異解析、ゲノム/染色体進化、大規模構造変異の機能、変異体画像等を研究テーマとしている。
研究内容の概要
数学的思考等の知的活動を計算機で自動化することには限界が知られている（ゲーデルの不完全性定理等）。逆に一部でも自動化できないかと考え、定理証明、データベース問合せ、機械学習、データマイニング等の効率化について研究してきた。近年は、生物における自動化の仕組み、すなわちゲノムがどのように情報をコードして細胞や組織を構築してゆき進化してきたかを理解したいと考えている。
キーワード
ゲノム解読、ゲノム進化、エピゲノム、クロマチン構造、変異体画像解析、フェノーム、 定理証明、データベース問合せ最適化、機械学習、データマイニング