～メダカのセントロメアＤＮＡ配列の部分的解読に成功～

科学技術振興機構（JST）

東京大学

概要

ＪＳＴ 戦略的創造研究推進事業において、東京大学の森下 真一教授らと武田 洋幸教授らは、長いＤＮＡ断片の解読技術を改良し、脊椎動物のモデル生物であるメダカのセントロメアＤＮＡ配列の約１０%（約１００万塩基）を解読することに成功しました。

２１世紀に入りヒトをはじめとする哺乳類を含む、脊椎動物のＤＮＡ配列の解読が進みましたが、完全には解読されておらず、いまだに脊椎動物のＤＮＡ配列には数百から数十万の解読できていない領域が残されています。とりわけ、セントロメアと呼ばれる長い領域は未解読のままでした。

本研究グループは、数万の塩基のＤＮＡ断片を解読する装置を活用し、DNA断片の解読を行いましたが、１分子のＤＮＡを直接観測するためノイズが入るといった難点がありました。今回、ノイズを取り除くために複数の補完的な手法で補正した結果、脊椎動物のモデル生物であるメダカを対象に、セントロメアのＤＮＡ配列の約１０％（約１００万塩基）を解読することに成功しました。また、セントロメア配列のＣｐＧメチル化状態の解析技術についても開発し、染色体の中心に近いほど塩基変異が有意に蓄積されることを明らかにしました。ヒトゲノムの約１～２％はセントロメア配列が占めると推定されていますが未解明であり、今回のメダカゲノムの研究はその解明への手がかりにもなると期待されます。

本研究成果は、２０１７年１１月２８日（英国時間午前１０時）発行の国際科学誌「Nature Communications」に掲載されました。

―東京大学大学院理学系研究科・理学部 広報室―